Q: 墨卓单细胞转录组数据可以和10X的单细胞转录组数据整合分析吗?

1. fastq数据不可直接合并,墨卓数据与10x数据的reads结构并不一致,barcode白名单也不相同;

2. 细胞-基因表达矩阵(filtered-cell-gene-matrix)可进行合并,推荐使用Seurat、liger、Harmony、Scanorama等软件进行去批次处理。