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单细胞VDJ测序数据量的合适大小取决于多种因素,包括样本复杂度、测序深度、实验设计等。
一般来说,单细胞V(D)J测序的目的是获得尽可能完整的克隆型信息,因此需要足够的测序深度来支持高质量的重排和克隆型识别。根据经验,每个单细胞至少需要测序到4000条reads,以保证高质量的VDJ分析结果。
需要注意的是,对于不同的实验设计和研究问题,需要根据实际情况来选择合适的测序数据量。对于一些研究问题,可能需要更深的测序深度,而对于一些其他问题,可能只需要较少的测序数据量。因此,在进行实验设计和数据分析时,应该综合考虑多种因素,并根据实际需要来选择合适的测序数据量。