在进行原始FASTQ文件的分析之前，通常需要对文件进行命名。虽然不同的实验室和分析流程可能有不同的命名规则，但通常应该满足以下一些基本要求：

1. 文件名应该能够清晰地反映样本来源，包括样本编号、组织来源、处理方式等信息。这些信息可以用下划线或短横线等字符分隔，例如:
   Sample1_Blood_RNAseq_R1.fastq(.gz)与Sample1_Blood_RNAseq_R2.fastq(.gz)。
2. 文件名应该包含一些关键的实验信息，例如测序类型与测序平台等信息。这些信息可以用下划线或短横线等字符分隔，例如：Sample1_Blood_RNAseq_Illumina_PE.fastq(.gz)。
3. 文件名应该能够唯一标识每个FASTQ文件，避免重复命名或覆盖已有数据。可以使用独特的文件名或带有时间戳的命名方式，例如：Sample1_Blood_RNAseq_Illumina_PE_20220331.fastq(.gz)。

需要注意的是，命名规则应该保持一致，并且尽可能遵守一些通用的命名约定，以便于数据管理和共享。此外，一些分析软件和工具可能需要特定的文件名格式，因此在进行分析前应该查看相应软件的文档，以确定文件名的具体要求。墨卓的单细胞V(D)J输入文件命名方式详见第8个问题。